＞＞２．スクリプトの変数で共有変数とインスタンス変数はどういう使い分けで使用するのですか？

共有変数はわかりにくいですね．．．
たとえば「Ｗ＿Ａ」というウィンドウを作成して、このウィンドウで共有変数を使用すると、
このウィンドウのインスタンス「Ｗ＿Ａ１」「Ｗ＿Ａ２」を生成した際、共有変数はこの２つ
のウィンドウ「Ｗ＿Ａ１」「Ｗ＿Ａ２」で値を共有にすることができます。
インスタンス変数を使用した場合は、「Ｗ＿Ａ１」「Ｗ＿Ａ２」で変数はそれぞれ別々の値を
持つことになります。
実際のところ、私の場合は共有変数は一度もプログラムで使用したことが無いです。

全体を通してのコメントですが、なるべくPBのマイナーバージョンは上げておいた方が
良いと思います。
pb_beginnerさんの場合、PB5.0.02→PB5.0.04に上げることをオススメします。
上位バージョンの方が安定してますし、細かいバグも直っていることが多いです。