こんにちは。今が昼か夜か関係ない状態のてとらぽっとです。(;_;)
（というか、今日は何曜日ですか？　爆）

＞＞＞レスポンスとポップアップ、メインのみ使用の開発って一般的なのでしょうか。
＞＞
＞＞システムの形態にもよると思いますよ

＞システムの形態だけではなく、エンドユーザのレベルや知識によってもかわってきますね。
＞CUI（ホストの入力画面など）に慣れているエンドユーザには、
＞MDIの操作はやりにくいようですし、
＞エンドユーザがおばちゃんで、MDIにした時にメニューが1つカスケードしただけでも
＞どこに何があるかわからなくなってしまったりするものです。
＞かといって、個人でPCをもっているエンドユーザも今では普通で、その人たちには、
＞SDIでは、まどろっこしいものですよね。

＞まぁ、対企業向けのアプリケーションの場合は、システム部の人たちが
＞いらっしゃるでしょうから、よく話し合って画面設計をするべきでしょう。

こてちゅさんの意見に賛成です。
補足するなら【エンドユーザのスキルアップ】が見込める場合ですかね。
オフィスワークの職員さんは、最初こそ初心者であっても、PCを導入して他の市販アプリを
使いこなしてしまわれると、SDIで組んだ開発アプリに物足りなさを感じてしまう人も
いらっしゃるようです。

ただ、PBというツールを考えると、MDIの方が向いています。
理由はいろいろあるのですが、大きくは、

・PBはMDIフレームにしかツールバーがつかない。(;_;)
・MDIのシートとして管理した方が、すべてのインスタンスにアクセスしやすい。

のが思い付きます（他にもあるかも）。
２つめは開発の問題だと思うのですが、
迷子のメインウィンドウ（＝インスタンスにアクセスできない）ができちゃうことがあるので…。

ツールに合わせてシステムを作るのは（日本では）本末転倒という気もしますが、
RADの性能を活かそうと思ったら、ご一考ください。