M.Mさん、こんにちは。
2枚目です。
2000Byteの壁に阻まれ、ただでさえ読み難いものが
さらに、見にくくなってしまって申し訳ありません。
すでに、手法１で問題点を発見されているかも知れませんが、
最後までお付き合い下さい。宜しくお願いします。

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手法1の結果；
DOSが（黙視確認で）一瞬しか立ち上がっていないため、
レスポンスウィンドウも一瞬しか開かない。
見た感じ、FTPコマンドが実行されたときとは明らかに違う。
ファイル転送は実行されていない。
手法1実行時の考察；
?アプリケーションからレスポンスウィンドウを開くのに、
　無理があるのでは？
?API関数の処理と、FTPコマンド処理は何かバッティング
　することがあって、どうにかなってしまうのかしらん？？
?真似しただけなので、果たしてAPI関数の使い方は正しいのか？
→とりあえず、もっと簡単な手法で「転送.bat」処理待ちを
　行ってほかの部分が完成していることを確かめようということで、手法2へ
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【手法2】
→この後の処理で、ログファイルをOPENし、
　エラーがないか確認しているので、
　このように修正。
■ アプリケーションOPENイベント::af_main()
//バッチ実行
RUN(転送.bat FTPテキストパス　ログテキストパス)
//ファイル存在チェック
IF FileExists(転送処理ログファイルパス) = FALSE THEN
　　エラー処理
END IF
//ファイルサイズ取得
ll_FLength = FileLength(転送処理ログファイルパス)
//バッチ待ち
DO WHILE ll_FLength = -1
ll_FLength = FileLength(転送処理ログファイルパス)
LOOP
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手法2の結果；
バッチ待ち処理が無限ループになってしまう。
手法1同様の結果。
手法2実行時の考察；
?転送.batは一瞬起動しているが、FTPコマンドが実行されていないため、
　ログファイルが空ファイルになっている。
?ログファイルが空のため、無限ループになってしまう
→とりあえず、もっと簡単な手法で確かめようということで、手法3へ
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はぁ。
続きは、No.3に記述します。
ご面倒をおかけしますが、ご確認下さい。