Mutouさん、こんにちは。
インターネット上で半角カナの使用は避けてください。
Windows以外のマシンで参照すると文字化けする可能性があります。
半角カナは全角カナに置換しました。

＞ちなみに、ＢＣＰは本当に信じていいんですかね？
＞というのも、データが欠落した部分に関しては、端末を変えるとできたり、インポート時に
＞カンマのような記号（\'）がはいったりして、次回にテキスト出力してもう一度入れようとすると
＞入らなかったりということがあってから、ＢＣＰコマンドは使用していません。
＞なぜそうなるのかが解れば対処方法があると思うのですが．．．

これは登録するデータの問題ではないでしょうか。

＞ちなみに約１００万件で、５?６時間かかるのはあたりまえですかね？

直接比較はできませんが、OracleのSQL*Loaderならばサーバのスペックにも
よりますが、もっと速いです。

＞また、多数のテーブルを更新しつづけた場合に、更新が突如遅くなるって言う現象誰かわかりますか？

どちらにしてもPBの話題から外れてきているようですので、別のWeb会議室で
質問するか、ふりーとーくに場所を移した方がよいかと思います。
(私もSQL-Serverのネタが切れそうですので、これ以上のコメントは難しいです）