あみっこさん、こんにちは。
仕事に煮詰まりさらに現実逃避モード中のt.yと申します(爆)

＞データウインドウの検索引数が一つしか使えなくて悩んでおります。。。
＞それぞれの場合のデータウインドウを用意すれば簡単なのかもしれませんが、出来ればそれはしたくないのです。
＞If文で場合分けできたらいいな、と思いますが・・・。
＞これは、可能でしょうか？
え?っと、DWのSELECT文を変更したいということですね。
DWのSELECT文を取得/設定するプロパティに
dw_1.Object.DataWindow.Table.Select
というのがあります。
ここにDWのSELECT文がそっくり入っていますのでそれを変更すればOKです。
例えば
sSelect = \"SELECT a,b,c FROM table1 \"
IF 条件１ THEN
　sWhere  = \"WHERE a > 1\"
ELSEIF 条件２ THEN
　sWhere  = \"WHERE a = 10\"
ELSE
　sWhere  = \"WHERE a < 100\"
END IF
sOrder = \" ORDER BY a,b,c\"

dw_1.Object.DataWindow.Table.Select = sSelect + sWhere + sOrder 
という感じです。
極端なことを言えばSELECTの列の数と順さえあっていれば
WHEREやORDERは自由に変更してもOKです。(FROMはよかったかな？忘れました)
私の開発ではガンガンやってます。
同じ機能を持つ関数にSetSQLSelect()もあります。
上記プロパティ・関数の詳細はヘルプ参照です。
そっけない返答で申し訳ないですが、いかがでしょうか。