Hanafusaさん、こんばんは。

＞ Sybaseで *Select文* 中に IF文を使えるんですか？ 
＞ ストアドプロジャでは書けます(Oracleでも書けますよね？確か)が、
＞ Case When length(\'項目\') > 2 Then \'項目\' Else \'000\' End のことではないですよね？
＞
＞ 私の勘違いでしたら済みません。

Anywhereでも、SQLでIF文(正確にはIF式)を書けますよ。
IF式の中に、さらにサブクエリも使えます。ELSEIFは出来ませ
んけど(IF-THEN-ELSEを入れ子にすることは可能です)。
下記のSLECT文はSQL Anywhereで実行可能です。

select tb.koumoku_id,
    if tb.item_name = 50 then
       999
    else
       (select ta.name_id from sqc_item_table as ta
        where tb.koumoku_id = ta.koumoku_id)
    endif
from sqc_item_table as tb

IFの条件にIS NULLを使うと、NULLだったらこの値を返す、と
いった使い方も出来ます。