kobeさん、こんにちは。

＞ラジオボタンで複数選択した場合は、どのようにしたら良いのでしょうか？

ラジオボタンは、複数のうちの一つを選択するためのものですから、
チェックボックスを使用します。

＞データベースの中身：123
＞表示：●１●２●３
＞
＞データベースの中身：1・3
＞表示：●１○２●３
＞
＞データベースの中身：1・・
＞表示：●１○２○３
＞

このデータは、それぞれ１と２と３のカラムでしょうか？
それぞれがカラムであれば、それぞれをラジオボタンにすることは可能かもしれませんねぇ。
1列表示のラジオボタン････でも、スクリプトが面倒になるような･･･
それぞれ、ON／OFFなのであれば、やはりチェックボックスですね。