yoさん、こんにちは。

Window Open時にメニューのプロパティを変更しているということですよね？
はずしているかもしれませんが、メニューの作成方法を変更することで解消さ
れるかもしれません。

メニュー名称 = m_sheet
//インスタンス変数でメニューオブジェクト型変数を定義
m_sheet im_menu

//window open時
//メニューオブジェクト型の変数にメニューidを取得する。
im_menu=This.menuid

//メニューの作成例
im_menu.m_file.m_open.enabled = false

もしシート自体が別々であればメニューも別にするだけで解消されるかもしれません。