FJKさん、こんにちは。

＞２つのＤＢに対して、テーブルの構造（リポジトリ等含む）＆データの差分を取りたいのですが、
＞何か方法をご存知の方いらっしゃいませんか？

私はSybaseを使ったことがないのですが、テーブル定義などの情報を見るシステムビューが用意されていれば、
MINUS結合演算子で差分を抽出するSELECT文が書けると思います。

リポジトリのデータについては、どちらかを「正」として全件コピーするほうが早いかと。(^^;

＞２つのＤＢは、元々は同じもので、ＤＢの変更箇所を知りたいのですが、ツール／コマンドなど、
＞ご存知の方いらっしゃいましたら、教えて下さい。
＞
＞最終的には、ＤＢの修正管理を行いたいのです　(^^ゞ

参考になるかどうかわかりませんが．．．

私のところでは、CREATE TABLE文のSQLファイル（ASCIIファイル）を、常に「正」としています。
開発中にALTERした場合なども、上記「最新のCREATE文」と、これとは別に「変更したALTER文」を
きちんと管理するようにしています。
この状態を維持できていれば、あとで苦労しなくていいです。専用ツールも不要です。