shinsukeさん、こんにちは。

＞いえ、最初からPB6.5 + Oracle8 です。
＞今まで、この環境で問題なく呼び出せていたストアドプロシージャがある日から[smrf2smfが存在しないエラー]が
＞発生するようになったのです。
＞更に詳しく書きますと、
＞現在のユーザー[eigyoという名前]には25個のストアドプロシージャがありますが、これが20個を超えたあたりから
＞この現象が起きたような感じです。

これは不思議な現象ですね。
サーバ側でDiskやメモリが圧迫していて、ORACLEが動作不良を起こしているのでしょうか...
プロシージャを増やしたことで、システム表領域だかディクショナリだかが、何らかの異常をきたしているの
かもしれません。

＞もしかして、PBから認識できるストアドプロシージャの個数に制限があるのでしょうか？

PBから認識できるストアドプロシージャの個数に制限はないでしょう。
動的にプロシージャを見にいった時に、サーバーが「存在しない」と誤認しているだけだと思います。
サーバーを再起動するとか、ディスクをデフラグする等の処置で直らないですかね。