luftpostさん、こんばんは。

この件、似たような現象を前に経験したことがあります。

INIファイルにDB接続先の情報があるのですが、メモ帳で接続先を修正保存してアプリを起動しても、
何故か変更前のサーバーに接続されてしまうのです。
ProfileString関数で得た内容を表示させてみたら、やはり修正前の情報を拾っていました。

いろいろ調査していくうちに、以下の事が分かりました。
・この現象は、特定のPCでのみ再現する。
・PCを再起動すれば問題なし。
・メモ帳で修正保存したあと、すぐにアプリを起動すると変更前の値を取得してしまう。
・メモ帳で修正保存したあと、約40秒?60秒ほど待てば変更後の値を取得してくれる。

さらに、
・INIファイルの情報は、一種のリソース扱いになっていてキャッシュを経由している
とのウワサも耳にしました。（信憑性はないですけど）

再現する「特定のPC」にインストールされていたOSにバグがあったのかも知れません。
結局、INIファイルはうかつにエディタで修正しないほうが良いとの結論に達し、この問題は流しました。

Luftpostさんのケースと違うかもしれませんが、参考までに。
（でもWinNT4では問題なかったですよ）