ideaさん、こんばんは。

＞アプリケーションを通して、使用するDataStore(外部ソース)をApplication.Openで生成しておきます。
（中略）
＞開発環境から実行していた時は何の問題も無かったのですが、モジュールを作成・実行させると
＞FORループの最初の行のInsertRow( 0 )が失敗し(li_retに0が返る)、その後のSetItemも失敗
＞します。当然、IsValid( ds_bg_cols ) はTrueです。

動的に参照されたオブジェクトは exeファイルに含まれない
ということが原因ではないかと思います。
初心者の方がよくつまずかれるポイントで、最近では No.4643 で
M.Mさんが回答されていますので検索してみてください。

ちなみに、IsValidがTrueを返しているのは DataStoreオブジェクトが
Createされていることを差し、DWオブジェクトの存在を示すものではありません。