sugarさん、こんにちは。

＞データウィンドをsaveasするときに、エクセル（ヘッダ付き）で保存することが多いのですが、
＞ヘッダ部分となるカラム名をアルファベットで表現しているため、
＞エクセルに取り込んだ後にとても見にくくて仕方がありません。
＞
＞（emp_id,name,tel --> 社員番号、名前、電話番号としたい。）
＞
＞テーブルから作り直せば問題は無いとは思うのですが、
＞かなり作り込んだシステムのため、あまりその辺をいじりたくありません。

もともとテーブル名に２バイト文字を使うのはオススメしません（汗）。

DWがプロパティとして持っているデータベースカラム名 dbName が
ヘッダとして保存されるわけですが、これを日本語名に変更してから SaveAs すればいいです。
以下は実際に使っているスクリプトを簡単にしたものです。
日本語DWカラム名をデータベースカラム名にセットしています。
（実際はDWカラム名も英語の場合はタグを表示するなど工夫を加えています。）

integer	li_ColCount, li_col
string	ls_rc

li_ColCount = Integer(This.Object.DataWindow.Column.Count)
for li_col = 1 to li_ColCount
        ls_rc = This.Modify(\"#\" + String(li_col) + \".dbName=\'\" &
              + This.Describe(\"#\" + String(li_col) + \".Name\") + \"\'\")
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