nokinokiさん、こんにちは。

＞列名が重複する複数テーブルを更新する場合、皆さんはどうされていますか？
＞
私の場合、データウィンドウはインプット領域または表示領域としてのみ使い、
実際の更新は例えば「更新」ボタンとかを作ってスクリプト内に直接ＳＱＬ文を書いてしまいますね。
スクリプト長くて頭悪そうですが。。。
＞
＞Tble_AとTble_Bの２つのテーブルの更新日カラム（UpdYMD）を更新しようとしています。
＞（複数テーブルの更新の為、スクリプト内で更新特性を設定しています。）
＞
データウィンドウのＳＱＬは\"テーブル名\".\"カラム名\"という表記を使えばカラム名が同じでも
違うテーブルのカラムとして扱ってくれたと思います。
ペインタを使うと、カラムの名称も自動的に下記のようにしてくれてますね。
\"Table_A\".\"Updymd\",
\"Table_B\".\"Updymd\"
とＳＱＬに書いてあるとカラム名はそれぞれ
Table_A_Updymd
Table_B_Updymd
となるようです。こんな感じでどうでしょう？