えふさん、こんにちは。

＞本社にデータベース(Anywhere）をおいて、ISDN(64Kbps）経由でクライアントを接続した場合についてです。
＞プロトコルはＴＣＰ／ＩＰでの接続となります。
＞
＞本来ですと、３階層アプリケーションやブラウザを使用したアプリケーションが妥当かと思います。
＞質問前提は２階層アプリケーションを使用した場合になります。
＞
＞当然ＬＡＮ環境の速度とは異なりますが、１００行程度のデータウィンドウを表示しても３０秒前後は掛かります。
＞プログラムはローカルＰＣにありますが、やはりデータ検索程度のＳＱＬ文(SELECT文）を発行しても遅いのでしょう
＞か。

PowerBuilderのデータベース ペインタやISQLでSQL文は発行できると
思います。
環境があるわけですから、そのデータ検索程度のSQL文(SELECT文)を発行して
テストされてみてはいかがでしょうか。