横から大変申し訳ない･･･

んと、元の問題は、「メインフレームにデータを送信したい」って
ことでいいでしょうか？
どうしても、FTP＆PBでないとだめでしょうか？
データ転送用のツールを使用すれば、
文字コード変換も行ってくれるので、いろいろ悩まなくて済みますが･･･

ちなみに、異機種間データ転送ツールは、調べればいろいろあるのでしょうが、
わたしが知っているのは、下記のものしかありません。
（っつーか、うちの会社の製品だったりして･･･）

http://home.saison.co.jp/SIS/hulft/

で、商品情報をご覧ください。