ども。迅速なreplyでしたね?。

＞・APはすべてPB5.0.03に移行済です。
＞・移行のEXE作成時にDLLをいつも上書きしていたのですが（内容は変更せず）
＞  全移行後に実行すると最後に作成した物以外はアクセス違反になります。
＞・最初に移行したＡＰ一つを「すべて上書き」でEXEにすると、これが動いて、前回動いていたものが
＞  アクセス違反になります。また一つEXEにするとこれが動いて、前のが動かない。

# 上の文脈から察するに、EXEが分割されている…？ (@_@)

作られているsystemは、applicationが複数に分割されていてEXEが複数生成されるものか
それとも、ひとつのEXEでしょうか？
もし、複数のEXEにするとして、件のPBL fileは両EXEで共用されている、とか？
# もしこれならば、install先directoryを別々にすればいいと思うです。
# まったく同じfileが複数存在するのが許せれば、ですけどね。