mamaさん、こんばんは。

＞やりたいことは、まず、元になるテーブルから検索条件に該当するデータを取得して、
＞そのデータに対して、その他の複数のテーブルからデータを取得してwork用のテーブルにデータを落す
（略）
＞ （元になるテーブルとその他のテーブルは１対多の関係です。）

（略）
＞それとも、?ですべてのデータをデータストアに取得すること自体がよくないのでしょうか？

「すべてのデータをデータストアに取得する」ケースももちろんありますが、
この概略の情報だけでは、必要性が判断できません。

最近のクライアントの性能から考えると、数百件やそこらなら
ループでfilterしまくる力任せのプログラムでも
案外すんなり処理されたりしますね。

しかしながら、不必要にクライアントのリソースを浪費したくないので、
INSERT INTO ? SELECT 文を使い、SQL文を１回の発行で済むように考えることを
お勧めします。