ruroさん、こんにちは。

＞おなじ項目がちがうDBに存在したとして、
＞あるDWの参照DBを変えておなじ項目が存在する別のDBにつなぐ時、
＞せっかく作ったレイアウトが自動的に削除されてしまいますよね。
＞（SQL直接変えたにしろ、グラフィックスから変えたにしろ）
＞これを回避する方法が有ったら教えて下さい。おそろしい数のDWレイアウト変えなきゃ行けなさそうなので・・
＞

テーブルのレイアウトが違ってもSelect文が変わらないDWで
そのような現象にあったことはないんですが･･･
（開発環境と本番環境が違うなんて当たり前だったりしますから。）

それは、違うDBに接続した直後にDWペインタでDWオブジェクトを開くと
レイアウトが消えているというような現象なのでしょうか？
参照するDBを変える時、DWペインタは開いている状態なんでしょうか？

それとも、Select文を書き換える必要があるが、レイアウトはそのままにしておきたいので、
その方法を知りたい、ということでしょうか？