yoさん、こんにちは。

＞一つのイベントに長いスクリプトを記述すると、
＞コンパイル又は保存時に
＞「スクリプトの最大サイズを超えています」という
＞メッセージがまれに出ます。
＞一度これが出ると、そのイベントのスクリプトを
＞減らさないと保存できないようなので、
＞ウィンドウ関数等を使用して現状回避しているのですが
＞何か他にもっと良い方法がないでしょうか？
＞それとも開発環境側でなにか設定
＞しなければならない事があるのでしょうか？

１イベントまはた関数で記述できるスクリプトのサイズには制限があります。
回避するには、ウィンドウ関数などを使用して、スクリプトのサイズを減らす
しかなさそうです。

No.006583のコメントツリーを参考にして下さい。
（キーワード「スクリプト」で検索して引っかからないと思ったら、タイトル
　が半角カナになってた。皆さん、半角カナは使用しないよう注意して下さい。）