だんちょうさん、こんばんは。

＞現在6.5で開発を行っているのですが、しばしば以下の様な形でPBが異常終了します。
＞
＞・ウィンドウのメニューバー(ファイル、編集等)が消えてしまう。
＞・そのまましばらく操作していると異常終了。
＞・早めに気付いた場合、作業結果の保存は可能。
＞・主にデータウィンドウのsqlを表示した後に発生しやすい。

う?ん、現象から推測するとPBを継続して使用しているうちに、メモリリーク等が原因で
リソース(GDI)が不足してしまい、その結果画面の表示に異常が出たり、さらには固まって
しまっているように思います。

PB6.5のパッチは当てられましたか？現在、PB6.5では修正モジュール Cまで出ています
ので、まずはパッチを当てることをオススメします。