sunaoさん、こんばんは。

＞ローカルプリンターに出力する際、プリンターが印刷可能状態でないと
＞再試行かキャンセルの自動再開待ちの画面が出るじゃないですか。
＞この時、自動再開されると印刷を指示したウインドーがアクティブな状態になりません。
＞そのウインドーがボタンをファンクションキー対応にしてあるので、それぞれの処理が実行できません
＞マウスはなるべく使用したくないのです。

印刷時にエラーが発生した場合、ダイアログが表示されることがあります。
その場合、元のウィンドウがアクティブでなくなりますが、ダイアログを閉じても元のウィンドウが
アクティブになるとは限りません。(OSの動作なので、PBからはコントロールできません。)

マウスで元のウィンドウをクリックすれば、元のウィンドウがアクティブになります。
それをやりたくないとすると、アクティブにしたいウィンドウをレスポンスウィンドウにしておけば
必ず最前面に表示されますので、その状態で[ALT]+[ESC]キーを押してアプリケーションを切り替えれば
PowerBuilderアプリケーションに切り替わった時に、元のウィンドウがアクティブになるのでは
ないでしょうか。