格の進さん、こんにちは。

＞画面より金額を訂正した場合は計算フィールドの値が再計算されますが、
＞スクリプトで金額を変更した場合は再計算されません。
＞
＞また、GroupCalc()を発行してみましたが、やはり再計算されませんでした。
＞
＞スクリプトで値を設定後、再計算するにはどうすればよいのでしょうか？

私も同じ経験をしたことがあります。PB5.xのバグかもしれないのですが...
「スクリプトで値を設定する」方法として、ドット表記を使っていませんか？
ドット表記で設定した時、縦合計が更新されなかった記憶があります。（横計は問題なし）

ドット表記ではなく、SetItem関数で設定してやると大丈夫でした。
なお、PB6.xでは問題ないようです。