＞みなさん、こんにちは。
＞
＞プロジェクトペインタでプロジェクトの構築を行う場合に、動的に参照しているWINDOWやDATAWINDOWは
＞リソースファイルに記述し、そのリソースファイルを参照するように指定すると思うのですが、うまくい
＞きません。

リソースファイルには、確かウィンドウ名の指定はできないと記憶しています。
（データウィンドウはＯＫです。）

それで、動的に参照するオブジェクト（ウィンドウ／データウィンドウ）を含んでいるライブラリを、
ＰＢＤ／ＤＬＬ化すれば、動的に指定するウィンドウオブジェクトもＰＢＤ／ＤＬＬに含まれるのでは。