＞処理と設定は下記のとおりです。
＞・clickedイベントでウィンドウ関数を呼ぶ。
＞・ウィンドウ関数内のretrieveでデータを検索し、表示する。
＞・フォーカスが当たるカラムは最初のSetItemで使用している。
＞　（SetItemの位置を変えても、同じカラムにフォーカスはいく）
＞・画面上のｄｗは２つ
＞・現象のおこるｄｗは画面上の一番最初（左上）項目
＞　（タブ順330中120）
＞・現象のおこるカラムはダミーカラム
＞ （dw内でのタブ順は330中300）
＞・コマンドボタンの他のイベントは使用していません。
＞・dw、画面、関数でもTab順を変更したり、SetFocusは使用していません。

retrieve命令で行を読み直すと色々なイベントが起動されるので
そのせいではないかと思います。

記憶では行が何も無い(reset命令後）からretrieveすると
以下の順にイベントが起こったと思います。

１．retrievestart
２．retrieverow(一行読むごとに一回)
３．rowfocuschanged
４．itemfocuschanged
５．retrieveend

３．４．のあたりが問題になります。

retrieve後にフォーカスをセットしようとすると
やはり３．４．のイベントが起動されたりしてうまく行かなかった記憶があります。

あまりきれいではありませんが
フラグを立てイベント自体をスキップしてみてはどうでしょう。

ちなみにretrieveすると必ず一番最初（左上）のカラムにフォーカスは移動するようです。

記憶だけで書いているのであまり保証はいたしませんが
参考になったでしょうか？