どうも、こてちゅです。

＞以前に発言したことがあるんですが、PBの開発環境とPBのランタイムのバージョンは一致させない
＞とトラブルの種になります。
＞

PB6.0のアプリケーションを6.5のランタイムでというのは、M.M さんがおっしゃるとおり、
避けたほうがいいというより、出来ないといっても過言ではありません！
6.0と6.5では、アプリケーションで使用するランタイムが全く別物になります。

＞また、今回はPB6.0アプリとPB6.5アプリを同一マシンで動かすことが目的のようですが、
＞メジャーバージョンの異なるPBアプリは同居可能です。
＞　　　　　　　　　　　　　　　　（メジャーバージョンが異なるとDLL名も異なるため）
＞しかしメジャーバージョンが同じ場合は難しいでしょう。
＞　　　　　　　　　　　　　　　　（同じ名前のDLLになってしまい、区別ができなくなる）
＞
＞
＞こちらにはPB5.0.xの環境しかないので、PB6.0とPB6.5のDLL名について同じ名前かどうか判断
＞できません。PB6.0とPB6.5を使用されている方、コメントをお願いします。
＞

開発環境としての共存の方法は、
Sherd（スペルがちがう？確かめてないのでごめんなさい。）
という、DLLが入ってるディレクトリを6.0用と6.5用で別々に保存し、これを入れ替えることで
同一PC内に共存することが可能です。
ただし、この方法では6.0と6.5を同時にたちあげることはできません。