Tatsuさん、こんばんは。

＞一日がかりでやっと原因がわかったような気がします。（違うかも）
＞
＞ウィンドウのPFC_PREUPDATE()でDWのカラム（整数部５桁、小数部２桁）に計算結果をセットして
＞いるのですが、その際にTRUNCATEやROUNDを使用していなかったため、小数部が２桁以上になって
＞いました。
＞
＞上記の状態で更新をかけ、DWの値が1.1111111．．．にもかかわらず、DBの値は小数部２桁
＞までで更新され（1.11になるのかな)、DWの更新フラグもリセットされたとすれば、その後即座
＞に更新をかけると今回のようなエラーが発生するのではないでしょうか？

データウィンドウの更新特性で、UPDATE/DELETE文のWHERE句を
「キーカラムと更新可能カラム」とすると、更新対象のカラムの
WHERE句を文字どおり、

WHERE **TABLE.@@COLUM = \"AAAA\", **TABLE.##COLUM = \"BBBB\",......

といった具合に生成します。
この時のキーカラム/更新可能カラムの一致する条件のデータは、
データウィンドウが検索してきて保持している値が使われます。
この値がOracleで持っているデータの値と一致しなければ、問題
のエラーが発生します。
Oracle側で更新時に数値データのRoundが効いているのであれば、
可能性が高いですね。
データウィンドウのSQLPreviewイベントで、イベント引数sqlsyntax
のSQL文をチェックしてみてはどうでしょう？