うちでは、クラスライブラリとしては、基本的に３階層程度までとしています。
それ以上になると、デバッグや管理が大変になりますから。

で、継承元となるクラスライブラリには、汎用的に使えるものだけを組み込んで、どのシステムでも使用可能となるようにしています。
例えば、DWのDBErrorイベントの書き込みやコマンドボタンのマウスポインタを砂時計にする、ウィンドウを閉じる時にメッセージを表示する、ウィンドウの初期表示で画面中央にするなどです。
あと、仮想関数を用意しておいたり、ユーザイベントも用意したりしています。
機能によっては、フラグなどを用意して制御を行ったりなど、できるだけ汎用的になるようにして継承の階層を深くならないようにしています。

実際のシステムでの階層は５階層程度になりますが、そんなにレスポンスが悪いなどの不都合を感じる事は今のところありません。

確かに継承の階層が深くなると、その分のインスタンスを生成する事になり、画面表示などに影響が出るかもしれませんが・・・
全ての画面を1つの継承元から作成するなどのプログラミング規約により、回避できる部分もあると思います。