kumakoさん、こんにちは。

確かにPB7以前はINIファイルやレジストリの変更でプリンタの切替を実施していましたね。

過去ログを拝見し、ちょっと検索してみたら次の記事が見つかりました。
アシストさんのテクニカルインフォメーションです。

ftp://ftp.ashisuto.co.jp/pub/sybase/TechNote/J-TN023.pdf

15ページ目の「2.21プリンタ設定変更」には『レジストリ変更前にPrintSetUo関数を使うな』と
書いてあります。参考になるかは疑問ですが、一応お知らせしておきます。

今回は、必ず発生するわけではなく2つのジョブが同時に動いているわけではないので
１．印刷前の通常使うプリンターの取得(元に戻すための退避用)
２．プリンターの切替
３．印刷
４．もとのプリンターに戻す

の処理が2つのジョブで走って、タイミング的に出力先や元に戻すプリンターがおかしくなったわけでは
なさそうですね。
とすると、プリンターの切替処理を実施しない処理でPrintSetUp()を使っているルートを通り、
そのあとでジョブ1が走ったとか？あぁ、そんな単純な問題ではないですよね。失礼しました。