net_test1さん、こんにちは。

古い質問ですので、需要が無いかもしれませんが・・・
私の場合は、少し強引に管理させています(PB8)

1.開発クライアントからアクセス可能な共有フォルダを作成
　
2.開発クライアント
　ワークスペースなどは開発クライアントのローカルに作成
　ソース管理システムにPB Nativeを指定
　プロジェクトに(1)で作成した共有フォルダを指定してソース管理を行う

(1)のフォルダ内に、各オブジェクトのソースファイルが作成されますので、
この内容をSVNなどを使用して管理しています。
ただし、prpをソース管理すると、管理が煩雑になるために、ignoreで除外しています。

かなり面倒ですが、開発者には…
(1)PBローカルにてオブジェクト作成⇒ソース管理に追加
(2)ソース管理に追加した共有フォルダの関連ファイル(SR*,PBG)をSVN追加(更新)

(1)PBにてチェックアウト⇒ローカル作業⇒チェックイン
(2)チェックインした共有フォルダの関連ファイル(SR*,PBG)をSVN更新

(1)PBにてソース管理から削除
(2)ソース管理から削除した共有フォルダの関連ファイル(SR*)をSVN削除

といったオペレーションを行ってもらっています。

参考までに。