ふぁるこんさん、こんにちは。

＞本来ならばAlter table?文を実行するだけでよいのですが、
＞アプリとして実現するためにはどのようにしたらよいのか

動的SQLを使えば実現できます。
テーブル定義変更だけなら結果集合を返さないので比較的簡単で、
次のようなスクリプトを作成し、適当なイベントで実行します。
例はtest_tableのid_codeカラムをCHAR(3)に変更します。

string ls_alter_table

ls_alter_table = \"ALTER TABLE dba.test_table \"&
+\"MODIFY id_code CHAR(3)\"

EXECUTE IMMEDIATE :ls_alter_table  using sqlca;

動的SQLの詳細はマニュアルを参照ください。