Rumbaさん、こんにちは。

＞これはOSが98,2000ではこのような現象はたしか発生しなかったと思いますが、
＞XP+PB6.5特有の現象なのでしょうか？また、回避方法はあるのでしょうか？　
＞
＞何かアドバイスがありましたら、お願いいたします。
＞
PB6.5.1を使っていた頃を含め、(現在はPB8.0.3)WinXP下で使用したことがないので
参考程度に聞き流してください。

アシストさんのHPで公表されているPB対応OS一覧表では、
PB6.5もPB6.5.1もWinXPには正式対応していないようです。
6.5はWin98、6.5.1ならばWin98やWin2Kに正式対応しているとされています。
一般的には正式対応していなくても動くことは動いちゃいますけどね。
細かいところで、思ったように動いてくれないのかもしれません。
Rumbaさんの環境がPB6.5なのかPB6.5.1かが定かではありませんが、原因の可能性の1つとしては
考えられることかと思います。
当り障りのない回答で申し訳ありません。