shirasakiさん、こんにちは。
エディットマスクにこだわらないのであれば、
編集タブで　エディットにして、自動選択をチェックし、同じタブの中の書式に###,##0を設定
かつ書式タブでも###,##0を設定する
動作を見てもらわなければいけませんが、これではダメですか？

＞
＞エディットマスクで [numericmask!] マスクデータ型を指定して
マスクに ###,##0 を指定します。

そのエディトマスクに 1000 と入力後、フォーカスを移して
再度そのエディトマスクにフォーカスを戻し 
1000 の 1 だけを選択状態にしてから
2 を入力するとキーを押した瞬間に 20 となってしまいます。

【 希望する出力内容 】

1000 の 1 を 2 に変更しても 2000　

となるようにしたい
のです。

これはＰＢの仕様でどうにもならないのでしょうか？

なにか解決策があれば、
ご教授お願い致します。