usanさん、こんにちは。

まず・・・
PBのバージョンなどはなるべく記述（たしか、発言するときに選択できるはず）する
ように心がけてください。

＞現在、NTサーバーを起動すると、exeファイルが立ち上がるように、
＞スタートアップのところに、PowerBuilderで作成したexeファイルを登録
＞しています。
＞ですが、このexeファイルが上手く起動しません。
＞起動時には、以下のようなメッセージが表示されます。
＞「リスナーを起動できませんでした。
＞　52：分散処理の通信エラー：サービス名 pbserver が見つかりません。（C4E）」
＞このNTサーバーには、PowerBuilderがインストールされていませんが、
＞それが問題でしょうか？

スタートアップにいれずにEXEを起動するとどうなんですか？
それはうまくいっていて、スタートアップフォルダにショートカットを作成したときだけ、
エラーが出るのでしょうか？
PBは、インストールされていなくても実行はできます。ただし、ランタイムライブラリ（DLL）が
なければなりません。詳しくは、ヘルプまたはドキュメント、過去ログを参照してください。

あと・・・pbserverが見つからないって･･･何をしようとしているのだろう？