うにさん、こんばんは。

＞・dw作成時の「テーブルの作成」にテーブル名が表示されない。
＞・「システムテーブルを表示」をチェックするとテーブル名は表示されるが定義した名称と異なる。(末尾に
$が付く)
＞・上記のままクエリを作成すると、「FROM句のエラー」になる。
＞・付属品のマニュアルどおりに、テーブル名（エクセルのシート名）は全て大文字にしている。

おそらくテーブル名の定義方法が間違っていると
思います。
ODBCドライバに依存する部分が大ですが、Microsoft
のExcel用ODBCドライバはテーブル名=シート名で
はなく、シート上のセルの選択範囲に名前を付け
ておき、それをテーブルとして扱っています。こ
こで付けた名前がテーブル名になるわけです。
Excel97までそうだったのですが、2000で仕様が
変わっているかもしれませんが。