pekoさん、こんにちは。

＞オラクルにPBCAT???というテーブルが作成されるのですが
＞このテーブルはどのタイミングで作成されるのでしょうか。
PBが使用するシステムテーブルは、PBの開発環境から、
データベースへはじめて接続する際に作成されます。
因みにOracleだけでなく、どんなDBMSでもこのシステムテーブルは作成されます。
その利用方法や概要などは、「ユーザーズガイド」マニュアルの
付録A PowerBuilderリポジトリを参照してください。
もし、マニュアルをお持ちでなければ、
http://powersoft.ashisuto.co.jp/support/pb6obook/tohtml/index.html
にVer6.5のマニュアルがあります。

＞また、これらのテーブルをすべて消去しても動作が
＞おかしくなることはないのでしょうか。
開発環境からの接続で、このテーブルがないと自動で作成されます。
また、これを削除すると開発環境でDB接続すると作成されます。
はやい話が、これがないと開発できないってことになるかと思います。
本番環境でのこのシステムテーブルの必要性は、
編集様式などをこのシステムテーブルに登録し、それをDWなどで
使用している場合には、エラーになる可能性があります。
（当方では、使っていないので、未検証です。）