Takaさん、こんにちは。
コメントありがとうございます。

＞masarさん、おはようございます。
＞
＞＞メインのウィンドウにTopMost!をかけて、最前面に表示しています。
＞＞このメインウィンドウからポップアップで子ウィンドウを表示しています。
＞＞この子ウィンドウでメッセージボックスを表示すると、後ろに隠れてしまって困ってます。
＞
＞この件は確か、PB5.0.02の不具合だったと記憶しています。PB5.0.04で修正されています。
＞（TopMost!の影響かどうかは解りませんが...）
＞
＞この件だけでなく、他にも細かなバグが修正されていますのでバージョンアップをおすすめします。
＞この件とは関係ないですが、PB5.0.04より低いバージョンは Y2Kに対応していません。
＞

そうでしたか・・・仕様かと思ってました（＾＾；
Ver.UPしてやってみます。ありがとうございました。

今後とも宜しくお願いします。