どなたかお知恵をお借りしたいのですが、
プロジェクトペインタでEXEを作成し、そのEXEのプロパティを確認すると、
バージョン情報をみることが出来ますが、ここにPowerBuilderのバージョン6.50.xx
が入ってきます。これを変更することができるでしょうか？

Tecｈwiredにて調べたところ、

EXE作成時にバージョン情報を変更する機能はPowerBuilderにはありません。 
ただし、お客様の作成されたEXEファイルの中には、PowerBuilderが生成したコードも含まれるため、
部分的な著作権はSybase,Inc.にあるという考えで、表示しております。
これは、部分的な著作権ですので、可能なツールを使用してこの表示をお客様が変更していただいても結構です。

とありました。
この「可能なツール」というのはインストーラのことでしょうか？
InstallBuilderしか使用していないため、分かりません。
もし、おすすめのものがあればよろしくお願いいたします。